Санаторий «им. Н.К. Крупской» имеет хорошо оснащенное современное диагностическое отделение. Оно включает клиническую и биохимическую лаборатории и следующие кабинеты: PH-метрии, функциональной диагностики, рентгенологический, ректороманоскопии.
Для оздоровления детей применяются следующие виды санаторно-курортного лечения: правильный режим дня, лечебное питание, климатолечение, лечебная физкультура, наружное и внутреннее применение минеральных вод, грязелечение, аппаратная физиотерапия и другие специализированные методы лечения.
Детям назначают щадящий, тонизирующий режимы с учетом чередования нагрузки и отдыха. В основе лечебного процесса лежит бальнеолечение. При этом используются уникальные углекислогидрокарбонатные сульфато-натриево-кальциевые воды железноводских источников. Они являются единственными в мире термальными кальциевыми водами. Прием минеральной воды непосредственно из «Славяновского» и «Смирновского» источников является основным видом лечения гастроэнтерологического профиля. Минеральные воды Железноводска используются также для кишечных процедур, тюбажей и ванн.
По медицинским показаниям детей лечат иловой сульфидной грязью солёного озера Тамбукан (грязевые аппликации, электрогрязелечение).
Проходят занятия Лечебной физкультурой. У санатория есть гимнастический зал, оснащенный современными тренажерами и спортинвентарем; есть кабинеты механотерапии, лечебного массажа. Все дети занимаются утренней гимнастикой и ЛФК.
Физиотерапевтическое отделение имеет кабинеты: светоэлектролечения, ультразвуковой терапии, микроволновой терапии, электрогрязи. Постоянно работает кабинет кислородного коктейля. Прекрасно оборудован стоматологический кабинет и кабинет галотерапии. В санатории есть собственный ингаляторий, где лечат сопутствующие заболевания носоглотки и верхних дыхательных путей.